实验室努力营造与国内外同行进行学术交流与合作的平台，分别与美国、德国、法国、日本、香港等国家和地区的学术研究机构和国际知名制药企业（如美国辉瑞公司、日本卫材制药公司、法国Pierre-Fabre公司等）建立了实质性的合作关系，还成功地举办了一系列重要的学术会议，比如：第三届亚洲药物化学国际研讨会，化学生物学国际研讨会暨第二届全国化学生物学学术会议，后基因组时代新药研发国际学术讨论会，第四十届IUPAC大会第二分会，第一届核酸和糖化学生物学圆桌会议，第四届Sino-US教授会，等等。另外，实验室还以开放课题的形式支持和鼓励国内同行开展符合实验室研究方向的合作研究。